La religión predominante es el Cristianismo sobresaliendo la iglesia católica, con libertad de cultos. En el país se practica toda clase de religiones y creencias.En la historia pasada, el gobierno de la república estaba unido con la jerarquía católica y a partir del gobierno del General Francisco Morazan, el Estado se separó de la Religión para dejar a la población libre de escoger la fe que mas le parezca.
Algunas instituciones gubernamentales como las Fuerzas Armadas públicamente declaran ser seguidores de la Virgen María con lazos muy íntimos en el catolicismo donde tambien existe los catecumenos.
Patrona de Honduras: Vírgen de la Inmaculada Concepción, conocida también como la Morenita o la Vírgen de Suyapa.
Arzobispo de Tegucigalpa: Juan José Pineda

Aparte del cristianismo católico, existe una proporción importante de creyentes cristianos protestantes que abarcan distintas denominaciones como luteranos, bautistas, asambleas de Dios, pentecostales, adventistas, etc. Tambien hay bahá'ís, y seguidores de algunas sectas como los Testigos de Jehová (Organización Watchtower), Mormonismo, y organizaciones de origen místico como la Logia Masónica, los Rosacruces, etc.